
2024年9月由扬州农业科技学校张万刚硕士生导师团队合作在期刊Journal of Agricultural and Food Chemistry发表题为“Exploring the Effects of S‑Nitrosylation on Caspase‑3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro”文章,研究发现了GSNO处理后caspase-3的活性显著降低(P < 0.05),并表现出剂量依赖性的抑制作用,其在半胱氨酸116、170、184、220和264位点被S-亚硝基化,进一步抑制了其对牛肉肌原纤维蛋白的蛋白水解能力。拜谱海洋生物为该研究提供了亚硝基化体现组学拜谱生物,助力发现目的蛋白上的亚硝基化修饰位点。
中文名字宝贝标题:体外研究S-亚硝基化对牛肉Caspase-3修饰和肌原纤维降解的影响
杂志期刊:Journal of Agricultural and Food Chemistry
202历经四年决定成分:5.7
发表论文时段:2024年9月
客服公司的:南京农业大学
的研究建筑材料:蛋白
拜谱出示技术设备:亚硝基化修饰组学
的技术风格:
一、的研究报告
01.Caspase-3抗逆性
现有尚不了解清楚NO对caspase-3的减弱使用是否有归因于NO介导的S-亚硝基化,各种渗透压梯度方向的GSNO是 外源性NO厂家直销,以诱骗caspase-3的身体S-亚硝基化。结果显示表示,与没了GSNO的组比起来,100、200和400μM GSNO组的caspase-3化学活化不错减低(图1),与事先新闻报道不一样。GSNO治理减低caspase-3化学活化的潜在的其原因仍尚需确立。
图1 不一样的溶液浓度的GSNO外理对caspase-3活性氧的影晌
02.Caspase-3的S-亚硝基化水平
理论探究Caspase-3的亚硝基化限度,以具体分析GSNO对Caspase-3的作用性。经GSNO办理后,加测到caspase-3蛋白质S-亚硝基化硬度添加(图2)。许多结局认为,外源性GSNO养育可成功的英文引发caspase-3的体内S-亚硝基化。惹人惊愕的是,在没能GSNO现实存在的参考组中加测到这个暗淡的S-亚硝基化带,这认为caspase-3也许出现内源性的S-亚硝基化。最后,本理论探究中caspase-3的S-亚硝基化限度较高,而caspase-3的活性氧有效降低,这与的时候的理论探究不同。当然,caspase-3的特情人S-亚硝基化淡化位点尚不知道,还要求进1步的研究。
图2 GSNO清理对caspase-3S-亚硝基化水平面的后果
03.Caspase-3的S-亚硝基化位点
通过亚硝基化绘制组学检测caspase-3的S-亚硝基化位点。结果表明,caspase-3上的4个多肽中有5个半胱氨酸残基被蛋白S-亚硝基化修饰(图3)。亚硝基化半胱氨酸定位于SSFVCVLLSHGEEGIIFGTNGPVDLK,GTELDCGIETDSGVDDDMACHKIPVEADFLYAYSTAPGYYSWR,DGSWFIQSLCAMLK和KQIPCIVSMLTK的多肽中,分别位于116、170、184、220和264位。S-亚硝基化caspase-3多肽的MS1和MS2光谱显示Caspase-3是一种具有8个半胱氨酸残基的半胱氨酸蛋白酶,其中5个半胱氨酸被发现被亚硝基化,说明Caspase-3易受亚硝基化修饰(图4)。此外,据先前报道casase-3的催化残留亚硝基化Cys163,这不同于本研究的结果。S-亚硝基化caspase-3的丰度、位点的修饰水平和检测方法的灵敏度的差异可能是导致结果不一致的原因之一。可以推断,半胱氨酸蛋白酶活性的调节可能是由NO和蛋白S-亚硝基化介导的,这可能影响蛋白降解,促进死后衰老。
图 3 caspase-3的回文编码序列。蓝标记图片图片的回文编码序列认为S-亚硝基化肽,红白色标记图片图片的C认为S-亚硝基化半胱氨酸
图4. s-亚硝基化肽和caspase-3位点的MS1和MS2光谱分析
04.S-亚硝基化Caspase-3生物降解结淀粉酶
结球球蛋清酶最为一项决定性的人体癌细胞骨架球球蛋清酶,在保证肌人体癌细胞框架的框架完好性和缩水性工作方面起着决定性功能,探究S-亚硝基化caspase-3对结球球蛋清酶化学生物降解的强烈性兼备着决定性积极意义。与Std(未用胱天球球蛋清酶酶-3和GSNO孵育的初使肌棉植物纤维球球蛋清酶)组相较,0 μM GSNO组(肌原棉植物纤维和caspase-3的孵育,无GSNO)的完好结球球蛋清酶分量的取得减低,的提示caspase-3对结球球蛋清酶兼备着未知的球球蛋清酶淀粉水解功能。在GSNO孵育后,完好结球球蛋清酶的分量的显然扩大(P < 0.05)。与此同时,当GSNO分量上升时,完好结球球蛋清酶的分量的持继调整(P < 0.05)(图5)。某一得知是因为,SNO装饰的caspase-3以横向依赖于的方法可抑制结球球蛋清酶的化学生物降解。
图5.S-亚硝基化caspase-3可降解结蛋白质
05.S-亚硝基化Caspase- 3生物降解肌钙蛋白酶-T
肌钙淀粉酶-T (TnT)是原肌球淀粉酶调低否则手臂肌肉收敛的丝条的须得肌原弹性玻璃纤维棉淀粉酶。TnT的溶解本质特征是论文检查测量到28和30 kDa的TnT。在亚硝基化具体条件下,caspase-3对TnT的溶解情形如图所显示6所显示,与Std组(不标caspase-3和GSNO的肌原弹性玻璃纤维棉)较之,caspase-3组中30 kDa TnT场面强势不断增加,阐明caspase-3积极参与了TnT的溶解,因此,caspase-3与GSNO的孵育使得30 kDa TnT骤降。在100和200 μM GSNO组两者之间未论文检查测量到比较突出的距离(P > 0.05),而当GSNO的氨水浓度达标400 μM 时,该场面强势缩短(P < 0.05)。这一些遇到阐明了SNO体现语的caspase-3对TnT溶解的仰定制用。结淀粉酶和TnT是caspase-3的脆弱底物,而GSNO补救拉低caspase-3的渗透性将使得肌原弹性玻璃纤维棉淀粉酶溶解限度拉低。总而言之所说,NO诱导性的S-亚硝基化是可以利用体现语半胱氨酸残基来调低caspase-3的渗透性,行而进的一步会应响其对结淀粉酶和TnT的淀粉酶蛋白质水解专业能力,因而会应响牛肉片品质保证。
图6. S-亚硝基化caspase- 3降解塑料肌钙血清-T
二、个人总结
本探究此次研讨S-亚硝基化对caspase-3突显的印象基本马上又对牛羊肉肌原仟维休外降解塑料的印象。核蛋清S-亚硝基化会突显caspase-3的半胱氨酸残基,关键在于从而导致caspase-3生物减小,进这一步控制了其对牛羊肉肌原仟维核蛋清的核蛋清水解反应专业能力。三、拜谱个人心得体会
探索通过了酶活分析一下,亚硝基化掩盖组学分析一下,WB等判断手法,会发现血清S-亚硝基化应该掩盖caspase-3的半胱氨酸残基,这使得了caspase-3亲水性的减少,并举一歩治理和改善了其对鸡肉肌原弹性纤维血清的血清电离意识。本探索为表达血清质亚硝基化对肉质地的宏观调控考核机制给予了一大个新的感觉。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供完善成熟的蛋清质组学、突显蛋清质组学、细胞代谢组学、转录组学等多组学产品技术服务体系,整合多组学数据进行深入挖掘分析,全面解析机制机理等,助力高分文章发表。除此之外,拜谱生物还可提供半胱氨酸款型物品,包括亚硝基化、谷胱甘肽化、硫巯基化、次磺酸性反应、total氧化物恢复、分离巯基,欢迎大家咨询!
学习医学文献:
Qin Hou, Chao Ma, Rui Liu, Zhuangli Kang, and Wangang Zhang.Exploring the Effects of S-Nitrosylation on Caspase-3 Modification and Myofibril Degradation of Beef In Vitro. Journal of Agricultural and Food Chemistry. doi.org/10.1021/acs.jafc.4c06663